中聯油脂事件使得近期大宗物資原料「黃小玉」進口到港，在政府從嚴把關下幾近每艘散裝船都要檢驗，業經五天檢驗程序後才能卸貨，導致台中港、高雄港船隻嚴重塞港，包括進口商、植物油公會、釀造公會、飼料公會等均向政府表達原料供應不足困境，但未獲回應。

　　業界指出，過去政府檢疫、檢驗大宗物資源頭原料包括黃豆、玉米、小麥等都是以抽驗進行，現在則逐批逐船檢驗；造成大宗物資嚴重塞港原因，除了中聯油脂因停工，原卸貨逾4.2萬噸巴豆在台中港1號碼頭倉無法進廠，僅剩3號碼頭倉還要塞進其他散裝船進港的黃豆、小麥、玉米，尤其玉米量大早就塞爆港倉，另一關鍵原因就是從嚴檢驗，逐船逐批檢驗都要耗掉五天檢驗期才能過關，因台中港塞港，轉赴高雄港一樣塞港。

　　財政部表示，經查海關對合格商品和原物料進口都依正常程序處理。營利事業如果受中聯油脂事件影響，致其商品或原料、物料、在製品等無法出售、加工製造而報廢，可依規定認列報廢損失抵稅，各區國稅局將積極協助及輔導受影響營利事業申辦報廢事宜。

　　業界指出，不論黃豆、玉米等都是大量進口自巴西或美國，且依世界標準規定2級以上的食用級黃豆均需在進口檢疫、抽驗，與過往不一樣是抽驗頻率百分之百增加，對進口商成本加重，相對抬高成本，恐有可能拉高上游油廠煉油、製油成本，若依進口總額千分之一估算成本增幅，加上倉租與船運逾期再加繳運費，以及匯率等總計成本相當可觀。

　　食品業者指出，黃豆油產出時程因原料進廠延後，牽動整個供應鏈產品供應也會呈現缺口擴大，包括食用油部分就有中聯油脂相關的3 5％缺口，不足部分有業者雖有部分選擇以其他廠油來替代，但目前最大廠大統益成本承壓之外，擴產也難以補足缺口獨撐大局。

　　而飼料業最重要原料豆粉也是來自黃豆，中聯油脂停工不僅少35％黃豆油，也少了3～4成豆粉豆粕，豆粉是動物飼料中重要的高蛋白營養，一旦有缺口就會直接影響農畜業飼養，恐影響畜牧業的動物生產速度，如果選擇菜籽粕或動物性蛋白取代，造成農民們飼養成本提高，且有可能反映在豬雞價格上。